上海交通大學設有船舶海洋與建筑工程學院、機械與動力工程學院、電子信息與電氣工程學院、材料科學與工程學院、環(huán)境科學與工程、生物醫(yī)學工程學院、航空航天學院、智慧能源創(chuàng)新學院、濮院未來職業(yè)技術(shù)學院、數(shù)學科學學院及其他學院，以下是具體名單，以供參考，可調(diào)整的，以學校最新公告為準。

1、工程

船舶海洋與建筑工程學院、機械與動力工程學院、電子信息與電氣工程學院、材料科學與工程學院、環(huán)境科學與工程、生物醫(yī)學工程學院、航空航天學院、智慧能源創(chuàng)新學院、濮院未來職業(yè)技術(shù)學院

2、科學

數(shù)學科學學院、物理與天文學院、化學化工學院、致遠學院、海洋學院

3、生命科學

生命科學與技術(shù)學院、農(nóng)業(yè)與生物學院、醫(yī)學院、藥學院

4、人文社會科學

安泰經(jīng)濟與管理學院、開元法學院、外國語學校、人文學院、馬克思主義學院、國際與公共事務學院、媒體與傳播學院、設計學校、體育系、上海高級金融學院、教育學院

5、國際教育

密西根上海交通大學、巴黎工程師學院、上海交通大學-南加州大學文化創(chuàng)意產(chǎn)業(yè)學院、中歐國際工商學院、中英國際低碳學院

6、研究所?基礎研究

系統(tǒng)生物醫(yī)學研究所、自然科學院、海洋研究所、李政道研究院、中國法律與社會研究所、變革分子前沿科學中心、張江高等研究院

7、研究所?應用基礎研究

能源研究所、航天科學技術(shù)研究所、汽車工程研究所、航空發(fā)動機研究所、燃氣輪機研究所、上海智能制造研究院、醫(yī)療機器人研究所、醫(yī)學影像先進技術(shù)研究所、人工智能研究院、三亞崖州灣深?？萍佳芯吭?、遠志機器人研究院

8、研究生院?綜合交叉

Bio-X研究所、Med-X 研究所、轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究所、個性化醫(yī)療研究所、董浩云航運與物流研究院（中美物流研究院）、新農(nóng)村發(fā)展研究院、碳中和發(fā)展研究所